MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 127151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008600	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008600	T	8	8	132	139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008600	TTATC	2	10	184	193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008600	T	7	7	259	265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008600	ACG	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008600	TATT	2	8	339	346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008600	TTG	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475779
9	NC_008600	AGG	2	6	395	400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118475779
10	NC_008600	A	7	7	454	460	100 %	0 %	0 %	0 %	118475779
11	NC_008600	CAA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475779
12	NC_008600	AAAG	2	8	515	522	75 %	0 %	25 %	0 %	118475779
13	NC_008600	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475779
14	NC_008600	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475779
15	NC_008600	TCC	2	6	680	685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118475779
16	NC_008600	GCA	2	6	699	704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475779
17	NC_008600	GAT	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475779
18	NC_008600	GCT	2	6	798	803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475779
19	NC_008600	TAGCCG	2	12	808	819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475779
20	NC_008600	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	118475779
21	NC_008600	ATGC	2	8	888	895	25 %	25 %	25 %	25 %	118475779
22	NC_008600	ATC	2	6	947	952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475779
23	NC_008600	ATA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475779
24	NC_008600	TAA	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475779
25	NC_008600	GAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475779
26	NC_008600	AAG	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475779
27	NC_008600	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475779
28	NC_008600	CCA	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118475779
29	NC_008600	AGA	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475779
30	NC_008600	CCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118475779
31	NC_008600	AAAGGC	2	12	1268	1279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475779
32	NC_008600	CAAAT	2	10	1321	1330	60 %	20 %	0 %	20 %	118475779
33	NC_008600	TTAA	2	8	1389	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	118475779
34	NC_008600	AGC	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475779
35	NC_008600	ATT	2	6	1440	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475779
36	NC_008600	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475779
37	NC_008600	TCC	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118475779
38	NC_008600	GAA	2	6	1626	1631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475779
39	NC_008600	TGG	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475779
40	NC_008600	A	6	6	1672	1677	100 %	0 %	0 %	0 %	118475779
41	NC_008600	GAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475779
42	NC_008600	AGT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475779
43	NC_008600	TAGA	2	8	1802	1809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008600	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008600	CTA	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008600	T	6	6	1873	1878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008600	ATTA	2	8	1885	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008600	TTCAA	2	10	1935	1944	40 %	40 %	0 %	20 %	118475780
49	NC_008600	AAG	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475780
50	NC_008600	TCT	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475780
51	NC_008600	ACA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475780
52	NC_008600	GAA	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475780
53	NC_008600	A	7	7	2184	2190	100 %	0 %	0 %	0 %	118475780
54	NC_008600	GAAA	2	8	2196	2203	75 %	0 %	25 %	0 %	118475780
55	NC_008600	AATTT	2	10	2261	2270	40 %	60 %	0 %	0 %	118475780
56	NC_008600	GAA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475780
57	NC_008600	CAT	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475780
58	NC_008600	TA	3	6	2432	2437	50 %	50 %	0 %	0 %	118475780
59	NC_008600	AACT	2	8	2444	2451	50 %	25 %	0 %	25 %	118475780
60	NC_008600	TGT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475780
61	NC_008600	GAA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475780
62	NC_008600	TTA	2	6	2603	2608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475780
63	NC_008600	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475780
64	NC_008600	TAT	2	6	2642	2647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475780
65	NC_008600	TCT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475780
66	NC_008600	AG	3	6	2703	2708	50 %	0 %	50 %	0 %	118475780
67	NC_008600	TAA	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475780
68	NC_008600	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475780
69	NC_008600	TTC	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475780
70	NC_008600	AGT	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475780
71	NC_008600	AGA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475780
72	NC_008600	AT	3	6	2928	2933	50 %	50 %	0 %	0 %	118475780
73	NC_008600	GATG	2	8	2934	2941	25 %	25 %	50 %	0 %	118475780
74	NC_008600	ATG	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475780
75	NC_008600	ATT	2	6	3031	3036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475780
76	NC_008600	AATT	2	8	3038	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	118475780
77	NC_008600	TACT	2	8	3057	3064	25 %	50 %	0 %	25 %	118475780
78	NC_008600	TAG	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008600	TTTA	2	8	3144	3151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008600	AGA	2	6	3332	3337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475781
81	NC_008600	ATT	2	6	3362	3367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475781
82	NC_008600	A	6	6	3442	3447	100 %	0 %	0 %	0 %	118475782
83	NC_008600	TGGCGA	2	12	3555	3566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475782
84	NC_008600	TCTTTG	2	12	3656	3667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118475782
85	NC_008600	A	6	6	3683	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	118475782
86	NC_008600	AAG	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475782
87	NC_008600	AAC	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475782
88	NC_008600	AT	3	6	3736	3741	50 %	50 %	0 %	0 %	118475782
89	NC_008600	TGA	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475782
90	NC_008600	TGT	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475782
91	NC_008600	AGA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475782
92	NC_008600	AAG	2	6	3808	3813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475782
93	NC_008600	CA	3	6	3889	3894	50 %	0 %	0 %	50 %	118475782
94	NC_008600	TAC	2	6	4023	4028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475782
95	NC_008600	AGA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475782
96	NC_008600	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475782
97	NC_008600	AAC	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475782
98	NC_008600	TGA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475782
99	NC_008600	TTC	2	6	4232	4237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475782
100	NC_008600	ACA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475782
101	NC_008600	ACGA	2	8	4282	4289	50 %	0 %	25 %	25 %	118475782
102	NC_008600	ATTGA	2	10	4316	4325	40 %	40 %	20 %	0 %	118475782
103	NC_008600	GAT	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475782
104	NC_008600	TAT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475782
105	NC_008600	GAT	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475782
106	NC_008600	ACG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475782
107	NC_008600	AAG	2	6	4485	4490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475782
108	NC_008600	AACG	2	8	4507	4514	50 %	0 %	25 %	25 %	118475782
109	NC_008600	ATAG	2	8	4532	4539	50 %	25 %	25 %	0 %	118475782
110	NC_008600	ATG	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475783
111	NC_008600	GTAT	2	8	4673	4680	25 %	50 %	25 %	0 %	118475783
112	NC_008600	ATA	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475783
113	NC_008600	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475783
114	NC_008600	ATA	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475783
115	NC_008600	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	118475783
116	NC_008600	CTG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475783
117	NC_008600	TTA	2	6	4877	4882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475783
118	NC_008600	TTC	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475783
119	NC_008600	TGG	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475783
120	NC_008600	GGC	2	6	4912	4917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118475783
121	NC_008600	TGG	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475783
122	NC_008600	GTA	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475783
123	NC_008600	ACA	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475783
124	NC_008600	A	8	8	5237	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	118475783
125	NC_008600	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475783
126	NC_008600	ATA	2	6	5393	5398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475783
127	NC_008600	AAC	2	6	5413	5418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475783
128	NC_008600	A	6	6	5758	5763	100 %	0 %	0 %	0 %	118475783
129	NC_008600	CGT	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475783
130	NC_008600	AGCAA	2	10	5895	5904	60 %	0 %	20 %	20 %	118475783
131	NC_008600	ATT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475783
132	NC_008600	ATT	2	6	6010	6015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475783
133	NC_008600	TTA	3	9	6077	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475783
134	NC_008600	TAT	2	6	6125	6130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475783
135	NC_008600	TTC	2	6	6136	6141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475783
136	NC_008600	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475783
137	NC_008600	GTT	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475783
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139	NC_008600	A	7	7	6220	6226	100 %	0 %	0 %	0 %	118475783
140	NC_008600	ACA	2	6	6349	6354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475783
141	NC_008600	CGT	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475783
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262	NC_008600	TGG	2	6	12509	12514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_008600	ACC	2	6	12680	12685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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267	NC_008600	GA	3	6	12933	12938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
268	NC_008600	CT	3	6	13050	13055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
269	NC_008600	CTGAA	2	10	13138	13147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_008600	CGG	2	6	13159	13164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_008600	CCT	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_008600	GGT	2	6	13653	13658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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